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一些生物遗体中的有机质在漫长的岁月中被分解，一些坚硬的部分会与包围着的沉淀物一起被石化成石头，但是还保留着原有的形态结构，逐渐形成化石。经过漫长的时间，骨架被逐渐分解，仅留下一个空腔，其他的矿物质填入缝隙中，逐渐形成化石。还有一些小生物，如果掉进植物滴落的树脂里就不会被分解，会形成一个天然标本。